책임운영기관 농촌진흥청 국립축산과학원

재래돼지(Korean Native Pig)는 우리나라에서 유일하게 유지되고 있는 고유 품종으로, 오랜 사육역사와 더불어 다른 품종과 유전적으로 차별된 특징을 지니고 있다. 본 연구에서는 유전체 정보를 기반으로 국내 사육되고 있는 재래돼 지 집단의 유전적 구조와 다양성을 구명하고자 한다. 6개 지역 집단의 재래종 353두와 외래 품종 4종(랜드레이스, 요크 셔, 듀록, 버크셔) 7,491두를 대상으로 전장유전체 분석 후 품종과 집단의 특성을 Runs of Homozygosity segment (ROH 단편) 기반으로 추정하였다. 재래돼지 품종 평균 근교계수는 0.49로, 랜드레이스(0.22), 요크셔(0.21), 두록 (0.29), 버크셔(0.23)품종에 비해 1.7-2.3배 높은 수준으로 조사되었다. 토착 또는 타 품종의 기여도를 분석한 결과, 재 래돼지의 토착 품종 기여도는 평균 69%로, 랜드레이스, 요크셔, 두록, 버크셔 등 타 품종과 유사한 수준(69–71%)으로 조사되었다. 세부적으로 재래돼지 품종 내 6개 집단의 토착 품종 기여도는 66–75% 범위로 조사되었다. 재래돼지 집단 간 혈연계수는 0.08–0.29 범위였으며, C집단과 E집단 사이의 혈연계수는 0.29로 두 집단의 유사성이 가장 높았다. 반 대로 B집단과 D집단의 혈연계수는 0.08로 가장 낮고, 특히 B집단은 E집단과 F집단과도 낮은 혈연관계(0.10)를 형성하 였다. 본 연구는 전장유전체 정보의 활용으로 타 품종과의 비교로 재래돼지의 유전적 특성을 정밀하게 구명하고 유전적 교류가 없는 집단 간의 혈연관계를 추정하였다. 따라서 본 연구의 결과는 특정 재래돼지 집단의 유전자원 복원이나 근교 계수 완화를 위한 집단 간 교류 전략 수립에 기여할 수 있다